Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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