Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms