Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trbv1A0A0B4J1G7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trbv1A0A0B4J1G7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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