Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms