Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Trav4-2A0A075B638 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Trav4-2A0A075B638 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trav4-2A0A075B638 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trav4-2A0A075B638 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Trav4-2A0A075B638 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Trav4-2A0A075B638 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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