Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
AireQ9Z0E3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AireQ9Z0E3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
AireQ9Z0E3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
AireQ9Z0E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
AireQ9Z0E3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms