Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx5Q9JKQ4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx5Q9JKQ4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx5Q9JKQ4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx5Q9JKQ4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Irx5Q9JKQ4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Irx5Q9JKQ4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx5Q9JKQ4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx5Q9JKQ4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Irx5Q9JKQ4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx5Q9JKQ4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Irx5Q9JKQ4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx5Q9JKQ4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx5Q9JKQ4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx5Q9JKQ4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx5Q9JKQ4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms