Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syde1Q9DBZ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syde1Q9DBZ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syde1Q9DBZ9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syde1Q9DBZ9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syde1Q9DBZ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syde1Q9DBZ9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syde1Q9DBZ9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms