Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N8

Pradc1, Protease-associated domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pradc1Q9D9N8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pradc1Q9D9N8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pradc1Q9D9N8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pradc1Q9D9N8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pradc1Q9D9N8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pradc1Q9D9N8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms