Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21,4■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,02
Mrto4Q9D0I8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Mrto4Q9D0I8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21,31■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21,3■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21,29■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21,27■■□□□ 1
Mrto4Q9D0I8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,26■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21,23■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21,22■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Mrto4Q9D0I8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,19■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,19■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,15■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21,14■□□□□ 0,98
Mrto4Q9D0I8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21,14■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21,11■□□□□ 0,97
Mrto4Q9D0I8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62,7 ms