Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itgb3bpQ9CQ82 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itgb3bpQ9CQ82 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itgb3bpQ9CQ82 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itgb3bpQ9CQ82 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb3bpQ9CQ82 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms