Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atoh8Q99NA2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atoh8Q99NA2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atoh8Q99NA2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atoh8Q99NA2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atoh8Q99NA2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atoh8Q99NA2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms