Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps50Q8CI71 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps50Q8CI71 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps50Q8CI71 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps50Q8CI71 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps50Q8CI71 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps50Q8CI71 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms