Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH15

Cnot10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot10Q8BH15 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cnot10Q8BH15 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cnot10Q8BH15 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Cnot10Q8BH15 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cnot10Q8BH15 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cnot10Q8BH15 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnot10Q8BH15 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnot10Q8BH15 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms