Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syne2Q6ZWQ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Syne2Q6ZWQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Syne2Q6ZWQ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Syne2Q6ZWQ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms