Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Casc1Q6TDU8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Casc1Q6TDU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Casc1Q6TDU8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Casc1Q6TDU8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casc1Q6TDU8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casc1Q6TDU8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Casc1Q6TDU8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casc1Q6TDU8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Casc1Q6TDU8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Casc1Q6TDU8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Casc1Q6TDU8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Casc1Q6TDU8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Casc1Q6TDU8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Casc1Q6TDU8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms