Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Hecw2Q6I6G8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Hecw2Q6I6G8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Hecw2Q6I6G8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Hecw2Q6I6G8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Hecw2Q6I6G8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Hecw2Q6I6G8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Hecw2Q6I6G8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Hecw2Q6I6G8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Hecw2Q6I6G8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Hecw2Q6I6G8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Hecw2Q6I6G8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Hecw2Q6I6G8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Hecw2Q6I6G8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Hecw2Q6I6G8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Hecw2Q6I6G8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Hecw2Q6I6G8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Hecw2Q6I6G8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Hecw2Q6I6G8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Hecw2Q6I6G8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Hecw2Q6I6G8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
Hecw2Q6I6G8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Hecw2Q6I6G8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Hecw2Q6I6G8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Hecw2Q6I6G8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Hecw2Q6I6G8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Hecw2Q6I6G8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Hecw2Q6I6G8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Hecw2Q6I6G8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Hecw2Q6I6G8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Hecw2Q6I6G8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Hecw2Q6I6G8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Hecw2Q6I6G8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Hecw2Q6I6G8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Hecw2Q6I6G8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Hecw2Q6I6G8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Hecw2Q6I6G8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Hecw2Q6I6G8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Hecw2Q6I6G8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Hecw2Q6I6G8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Hecw2Q6I6G8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Hecw2Q6I6G8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Hecw2Q6I6G8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Hecw2Q6I6G8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Hecw2Q6I6G8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Hecw2Q6I6G8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Hecw2Q6I6G8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Hecw2Q6I6G8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Hecw2Q6I6G8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Hecw2Q6I6G8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms