Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT9

Tbc1d30, TBC1 domain family member 30, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d30Q69ZT9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tbc1d30Q69ZT9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tbc1d30Q69ZT9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tbc1d30Q69ZT9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tbc1d30Q69ZT9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tbc1d30Q69ZT9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tbc1d30Q69ZT9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tbc1d30Q69ZT9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tbc1d30Q69ZT9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tbc1d30Q69ZT9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tbc1d30Q69ZT9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tbc1d30Q69ZT9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tbc1d30Q69ZT9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tbc1d30Q69ZT9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tbc1d30Q69ZT9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tbc1d30Q69ZT9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tbc1d30Q69ZT9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms