Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DbpQ60925 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DbpQ60925 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DbpQ60925 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DbpQ60925 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DbpQ60925 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DbpQ60925 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DbpQ60925 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DbpQ60925 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DbpQ60925 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DbpQ60925 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DbpQ60925 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms