Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap9-3Q3V2C1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap9-3Q3V2C1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Krtap9-3Q3V2C1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Krtap9-3Q3V2C1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Krtap9-3Q3V2C1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Krtap9-3Q3V2C1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms