Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pglyrp4Q0VB07 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pglyrp4Q0VB07 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pglyrp4Q0VB07 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pglyrp4Q0VB07 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms