Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Gbp1Q01514 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gbp1Q01514 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gbp1Q01514 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gbp1Q01514 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gbp1Q01514 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gbp1Q01514 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gbp1Q01514 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gbp1Q01514 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gbp1Q01514 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gbp1Q01514 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gbp1Q01514 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gbp1Q01514 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gbp1Q01514 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms