Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
EgfrQ01279 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
EgfrQ01279 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
EgfrQ01279 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
EgfrQ01279 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EgfrQ01279 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EgfrQ01279 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EgfrQ01279 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
EgfrQ01279 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EgfrQ01279 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
EgfrQ01279 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EgfrQ01279 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EgfrQ01279 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EgfrQ01279 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EgfrQ01279 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EgfrQ01279 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EgfrQ01279 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EgfrQ01279 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EgfrQ01279 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EgfrQ01279 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
EgfrQ01279 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EgfrQ01279 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms