Protein–RNA interactions for Protein: P97798

Neo1, Neogenin, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neo1P97798 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Neo1P97798 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Neo1P97798 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Neo1P97798 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Neo1P97798 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Neo1P97798 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Neo1P97798 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Neo1P97798 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Neo1P97798 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
Neo1P97798 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Neo1P97798 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Neo1P97798 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Neo1P97798 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Neo1P97798 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Neo1P97798 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Neo1P97798 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Neo1P97798 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Neo1P97798 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Neo1P97798 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Neo1P97798 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Neo1P97798 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Neo1P97798 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Neo1P97798 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Neo1P97798 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Neo1P97798 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Neo1P97798 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Neo1P97798 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Neo1P97798 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Neo1P97798 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Neo1P97798 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Neo1P97798 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Neo1P97798 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Neo1P97798 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Neo1P97798 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Neo1P97798 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Neo1P97798 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Neo1P97798 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Neo1P97798 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Neo1P97798 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Neo1P97798 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Neo1P97798 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Neo1P97798 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Neo1P97798 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Neo1P97798 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Neo1P97798 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Neo1P97798 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Neo1P97798 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Neo1P97798 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
Neo1P97798 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Neo1P97798 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Neo1P97798 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Neo1P97798 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Neo1P97798 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
Neo1P97798 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Neo1P97798 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Neo1P97798 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
Neo1P97798 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Neo1P97798 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Neo1P97798 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Neo1P97798 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Neo1P97798 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Neo1P97798 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Neo1P97798 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Neo1P97798 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Neo1P97798 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Neo1P97798 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Neo1P97798 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Neo1P97798 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Neo1P97798 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Neo1P97798 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Neo1P97798 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
Neo1P97798 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Neo1P97798 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Neo1P97798 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
Neo1P97798 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms