Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc8a1P70414 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc8a1P70414 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8a1P70414 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc8a1P70414 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc8a1P70414 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms