Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smad1P70340 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad1P70340 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad1P70340 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad1P70340 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad1P70340 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad1P70340 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad1P70340 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smad1P70340 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smad1P70340 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad1P70340 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad1P70340 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad1P70340 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad1P70340 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad1P70340 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smad1P70340 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad1P70340 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad1P70340 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smad1P70340 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms