Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,9■□□□□ 0,3
Defa3P28310 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Defa3P28310 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16,87■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,87■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,87■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16,87■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,86■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,86■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Defa3P28310 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16,86■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,86■□□□□ 0,29
Defa3P28310 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16,85■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16,85■□□□□ 0,29
Defa3P28310 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,83■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16,83■□□□□ 0,28
Defa3P28310 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16,83■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,83■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16,83■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,82■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,81■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defa3P28310 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defa3P28310 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16,8■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,79■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,79■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,78■□□□□ 0,28
Defa3P28310 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16,77■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,77■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,76■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa3P28310 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,75■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,74■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,74■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16,73■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,72■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16,72■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,72■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,71■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,71■□□□□ 0,27
Defa3P28310 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16,7■□□□□ 0,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,6 ms