Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pou2f1P25425 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pou2f1P25425 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pou2f1P25425 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pou2f1P25425 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pou2f1P25425 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms