Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccnd1P25322 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccnd1P25322 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccnd1P25322 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccnd1P25322 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccnd1P25322 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms