Protein–RNA interactions for Protein: P06796

Csn3, Kappa-casein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn3P06796 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csn3P06796 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Csn3P06796 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn3P06796 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn3P06796 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn3P06796 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Csn3P06796 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Csn3P06796 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn3P06796 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn3P06796 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn3P06796 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn3P06796 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn3P06796 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Csn3P06796 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn3P06796 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Csn3P06796 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms