Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prp2P05143 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prp2P05143 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prp2P05143 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prp2P05143 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prp2P05143 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prp2P05143 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prp2P05143 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prp2P05143 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prp2P05143 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prp2P05143 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prp2P05143 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prp2P05143 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prp2P05143 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prp2P05143 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms