Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vti1bO88384 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vti1bO88384 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Vti1bO88384 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vti1bO88384 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vti1bO88384 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms