Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sfta2E9PXB6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfta2E9PXB6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sfta2E9PXB6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sfta2E9PXB6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfta2E9PXB6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms