Protein–RNA interactions for Protein: A2AGL3

Ryr3, Ryanodine receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 4,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr3A2AGL3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ryr3A2AGL3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ryr3A2AGL3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ryr3A2AGL3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ryr3A2AGL3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ryr3A2AGL3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ryr3A2AGL3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ryr3A2AGL3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ryr3A2AGL3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ryr3A2AGL3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ryr3A2AGL3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ryr3A2AGL3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr3A2AGL3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr3A2AGL3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr3A2AGL3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ryr3A2AGL3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ryr3A2AGL3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms