Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm17196-201ENSMUST00000164074 345 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r46-202ENSMUST00000205088 10770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Ubxn4Q8VCH8 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms