Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm1123Q1RME4 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Igkv20-101-2-201ENSMUST00000200406 339 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm39388-201ENSMUST00000214502 1041 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm1123Q1RME4 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms