Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Igkv1-135-201ENSMUST00000103303 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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Hoxd1Q01822 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 2610044O15Rik8-206ENSMUST00000191043 504 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm37603-201ENSMUST00000192368 219 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm45523-201ENSMUST00000210712 799 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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Hoxd1Q01822 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 A430106G13Rik-201ENSMUST00000182158 3388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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Hoxd1Q01822 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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Hoxd1Q01822 Gm24225-201ENSMUST00000158825 98 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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Hoxd1Q01822 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Hoxd1Q01822 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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