Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr773-201ENSMUST00000072976 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ggta1P23336 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm29576-201ENSMUST00000188020 678 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm28354-201ENSMUST00000190904 678 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ggta1P23336 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms