Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mir3106-201ENSMUST00000175401 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm18403-201ENSMUST00000192907 529 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 2010110G14Rik-201ENSMUST00000196438 527 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Olfr747-201ENSMUST00000078075 955 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Vpreb2P13373 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm21035-201ENSMUST00000207867 2608 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Mir1193-201ENSMUST00000116761 121 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm43855-201ENSMUST00000197462 507 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm18921-201ENSMUST00000221798 366 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Vpreb2P13373 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms