Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm11394-201ENSMUST00000181421 517 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm29793-201ENSMUST00000202874 460 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr133-204ENSMUST00000215549 2944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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