Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr1286-202ENSMUST00000184954 3398 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
FxnO35943 Capn6-201ENSMUST00000087316 3561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm22343-201ENSMUST00000122648 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm45498-201ENSMUST00000210346 283 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr211-201ENSMUST00000065786 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm13488-201ENSMUST00000120419 179 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 AL645522.1-201ENSMUST00000197692 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 AC161269.1-201ENSMUST00000228426 318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
FxnO35943 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FxnO35943 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FxnO35943 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FxnO35943 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
FxnO35943 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FxnO35943 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
FxnO35943 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms