Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm4842-201ENSMUST00000183237 835 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm12062-201ENSMUST00000117533 259 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm44995-201ENSMUST00000207056 504 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm26001-201ENSMUST00000157989 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RpainQ9CWY9 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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