Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Nexn-211ENSMUST00000199423 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Tas2r139-201ENSMUST00000057686 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr483-201ENSMUST00000104917 1065 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm26933-201ENSMUST00000182320 827 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm6112-201ENSMUST00000208037 629 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm46436-201ENSMUST00000221851 1294 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Scgb2b31-ps-201ENSMUST00000188734 328 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Hoxd10P28359 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms