Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Mir676-201ENSMUST00000102443 89 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23887-201ENSMUST00000122683 172 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm11240-201ENSMUST00000142047 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 AC115970.1-201ENSMUST00000218910 1758 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm11020-201ENSMUST00000109447 186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm17023-201ENSMUST00000165885 448 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Hoxd9P28357 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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