Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm13574-201ENSMUST00000120482 394 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm44947-201ENSMUST00000208462 1981 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm16236-201ENSMUST00000159588 379 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
OtofQ9ESF1 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms