Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm7308-201ENSMUST00000121087 447 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps3-201ENSMUST00000122439 917 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vipas39Q8BGQ1 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r7-201ENSMUST00000176252 1219 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vipas39Q8BGQ1 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vipas39Q8BGQ1 Gm42896-201ENSMUST00000201249 1113 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vipas39Q8BGQ1 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vipas39Q8BGQ1 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Vipas39Q8BGQ1 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Vipas39Q8BGQ1 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Vipas39Q8BGQ1 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 AC087891.1-201ENSMUST00000217867 318 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Vipas39Q8BGQ1 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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