Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm26273-201ENSMUST00000104180 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 1700024B18Rik-201ENSMUST00000190088 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC153938.2-201ENSMUST00000218388 580 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC167192.3-201ENSMUST00000224096 1567 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm45439-201ENSMUST00000211723 359 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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Sh3bp1P55194 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
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Sh3bp1P55194 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Fam107b-206ENSMUST00000176254 300 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Sh3bp1P55194 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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