Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm44435-201ENSMUST00000204379 4119 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Ccl20O89093 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Ccl20O89093 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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