Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm12898-201ENSMUST00000144407 642 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Col5a3Q9JLI2 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm21170-201ENSMUST00000179330 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r2-202ENSMUST00000226198 1126 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr478-201ENSMUST00000049719 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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Col5a3Q9JLI2 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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Col5a3Q9JLI2 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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Col5a3Q9JLI2 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Macf1-203ENSMUST00000097897 23495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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Col5a3Q9JLI2 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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Col5a3Q9JLI2 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Gm2516-201ENSMUST00000210011 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Col5a3Q9JLI2 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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