Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm14469-201ENSMUST00000118363 202 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm18727-201ENSMUST00000185981 553 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Vmn1r194-201ENSMUST00000091737 891 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr1201-201ENSMUST00000073458 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm42457-201ENSMUST00000197572 367 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Usp27Q8CEG8 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms